| Resumo: |
Los begomovirus son patógenos de plantas que en las últimas décadas han causado importantes pérdidas a cultivos de interés económico, en regiones tropicales y subtropicales. En Cuba se han identificado nueve begomovirus afectando cultivos de importancia económica como tomate, fríjol, tabaco, pimiento, calabaza, papa, y malezas de diferentes familias botánicas. En este trabajo se analizaron las secuencias de la región intergénica (RI) y la región N- Terminal de la proteína asociada a la replicación (Rep) de los diferentes begomovirus identificados en Cuba, referidas en el banco de datos de genes (Genebank), utilizando programas estadísticos para los alineamientos, análisis filogenéticos y búsqueda de recombinaciones. La detección de posibles eventos de recombinaciones fue realizada para p=0 .05, basado en 10000 permutaciones. En la región intergénica se detectaron entre 11 y 15 sitios de recombinaciones, entre el virus del mosaico amarillo del Macroptilium (MaYMV) y los virus de la hoja rugosa del tabaco (TLRV), el virus moteado taino del tomate (TMoTV) y el virus del mosaico amarillo de Dicliptera (DiYMoV). En la región N-Terminal de la Rep., se detectaron además, 16 sitios de recombinaciones entre MaYMV y el virus amarillo dorado de la Sida (SiGYVV). Los virus del mosaico de Jatropha (JMV) procedente de Jatropha gossipifolia , y los aislamientos de TYLCV-IL(CU) de tomate y pimiento, mostraron secuencias que se encuentran en todos los sitios polimórficos detectados y que son homólogas a los sitios monomórficos, de los alineamientos analizados. En la región N-Terminal de la Rep del TTMoV y DiYMoV, se detectaron 3 y 4 sitios polimórficos respectivamente, con características similares a los anteriores y constituyen evidencia de recombinaciones pasadas y destruida en la evolución. Todos los sitios identificados en estos aislamientos pueden definir características de las especies de begomovirus identificados.
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